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如果您收到了京东快递的短信，但是在京东的物流追踪系统中查不到物流信息，可能有以下几种原因。
1、系统更新延迟：物流信息可能因为系统更新而暂时无法查看，您可以稍后再试，或者等待一段时间看是否有新的物流信息更新。
2、短信错误：有可能是您收到的短信出现了错误，并不是来自京东的快递短信，您可以核实一下短信的发送方，确认是否为京东官方发送。
3、订单号错误：如果您在查询时输入的订单号有误，也会导致无法查询到物流信息，请核对一下订单号是否正确。
4、包裹可能处于非常特殊的物流环节：如刚刚被揽收或者采用了一些特殊的运输方式（例如航空运输等），也可能导致物流信息无法立即在系统中显示。
针对以上情况，您可以采取以下措施：
1、稍后再试：等待一段时间后再查询物流信息，看是否有更新。
2、联系京东客服：如果仍然无法查询到物流信息，您可以联系京东客服，提供订单号等信息，询问他们是否有相关的物流信息。
3、核实短信和订单号：重新核实一下您收到的短信和订单号是否正确。
希望以上建议能帮助您解决问题，如果问题仍然存在，建议您联系京东客服寻求进一步的帮助。